蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成是药物化学领域中一个快速发展的研究方向，它围绕一类新型小分子药物——PROTACs（Proteolysis Targeting Chimeras）的构建展开。PROTAC不同于传统抑制剂只作用于蛋白活性位点，它通过诱导降解机制直接引导目标蛋白进入细胞的泛素-蛋白酶体系统，实现在功能层面上清除致病蛋白。蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成涉及将两个不同功能的配体（分别结合目标蛋白和E3泛素连接酶）通过一个连接臂连接，形成一体化的小分子。该分子能在细胞内促使目标蛋白与E3连接酶形成三元复合物，使目标蛋白被泛素化并随后降解。这一过程是事件驱动的——只需短暂接触目标蛋白即可启动其降解程序，因此蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成被视为突破不可成药靶点限制的一种创新策略，在肿瘤、自身免疫病和神经退行性疾病等研究领域引发广泛关注，也为新一代靶向治疗药物的研发提供了现实路径。

蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成的基本构思包括三个模块：目标蛋白配体、E3连接酶配体和连接臂。在实际合成过程中，首先需根据已知小分子抑制剂或配体库筛选出能够与目标蛋白特异结合的部分，这通常依赖于结构生物学、计算模拟和已有药物先导分子的改造。其次，E3连接酶配体的选择对PROTAC的降解效率和组织特异性影响显著，目前使用最广泛的E3配体包括CRBN（cereblon）和VHL（von Hippel-Lindau）。两者在不同细胞环境中活性和表达水平不同，因此需根据目标细胞类型匹配合适的E3配体。

连接臂的设计与合成是蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成的核心挑战之一。连接臂不仅决定了两个配体在空间上的排列，还直接影响三元复合物形成的稳定性与效率。若连接臂过短，可能导致构象紧张，无法形成有效复合体；若过长，可能降低分子内协同作用，影响降解活性。连接臂的极性、柔性和代谢稳定性同样关键，常见的连接单元包括聚乙二醇（PEG）、烷基链、有机氨基酸或杂环片段等。蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成往往需反复优化连接臂结构以提高细胞通透性、选择性和药效持续性。

在合成方法上，蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成多采用模块化策略，即先分别合成两个功能配体，然后通过化学反应将其偶联。常用的偶联方式包括酰胺键连接、点击化学（如CuAAC）、碳碳偶联反应等，需保证最终分子在结构上具有稳定性、在生物体内具备代谢兼容性。由于PROTAC分子量普遍偏大，脂溶性和口服吸收性可能较差，因此在合成过程中还需考虑对其理化性质的调控，包括通过引入极性基团、环化结构或前药策略提升生物利用度。

蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）合成完成后，功能验证是不可忽视的步骤。这包括目标蛋白的降解效率评估、靶向选择性检测以及细胞毒性分析等，常用方法包括Western blot、蛋白质组学定量分析、细胞活性检测和三元复合物形成分析等。对于降解活性优异的候选分子，进一步的体内药效评估和动物实验是推进其向临床开发的环节。

百泰派克生物科技专注于蛋白质组学、靶点验证与小分子研究服务，致力于为客户提供高质量的检测分析服务。选择百泰派克，您将拥有专业的技术支持与定制化的解决方案，共同探索蛋白靶向降解的创新边界。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

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