转录组（transcriptom）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合；狭义上指所有mRNA的集合。

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RAD（restriction site associated DNA）是与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA。RAD-Seq是对酶切获得的标签进行高通量测序，大幅降低基因组的复杂度，操作简便。

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环境微生物多样性检测解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，极大地扩展了微生物学研究范围。

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基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，通过全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。

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mRNA测序在检测基因表达的同时，还能够获取mRNA结构信息、识别可变剪切位点和cSNP突变、解析RNA编辑，从而获得更全面的mRNA信息。

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宏基因组测序是指对样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序，进行序列组装和基因注释，获得部分不可纯培养微生物的基因组序列，分析该环境下所有微生物基因集信息。

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新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间，让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求，细菌基因组测序可分为四种类型：细菌基因组Scanning、细菌基因组

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最新一代测序系统最高单序列读长可达1kb，读长较长，尤其适合于De novo测序和新物种的转录组测序。

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